幸存者们发现岛上存在神秘建筑入口，在杰克（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）的带领下进行探索，强制进入舱门后，发现里面竟然有人，且是杰克曾经在现实中有过一面之缘的戴斯蒙德（亨利·伊恩·库斯科 Henry Ian Cusick 饰），如同看到救星一般，戴斯蒙德留下一串数字密码便跑掉了，而杰克一行则需要接替他的任务——每隔108分钟输入密码以关掉警报。在舱门中，幸存者们找到充足食物，也由一卷录影带了解到这座孤岛的背景，似乎和某个失败的实验有关。另一方面，扎起竹筏试图离开岛屿的迈克尔（哈罗·佩里纽 Harold Perrineau 饰）等人并没有成功驶向深海，而是被潮水带到岛的另一边，发现还有一群机尾的幸存者，他们挟持着迈克尔等人慢慢向营地靠近……
第二季中，侦探杜尔西·柯林斯（凯特·波克斯 Kate Box 饰）和埃迪·雷德克利夫（玛德琳·萨米 Madeleine Sami 饰）将前往澳大利亚的Top End地区。她们起初在达尔文调查雷德克利夫前任警务伙伴布什的死亡案件，然而在一个偏远小镇发现了两名Top End知名人士的尸体，这开启了一场“更紧张、更棘手”的新调查。
